При работе в SmartGIT иногда возникают трудности ввиду не правильного восприятия программой кириллических символов. Впрочем решение проблемы очень простое.
Просто укажите в файле .git/config следующие строки:
[gui] pruneduringfetch = true encoding = UTF-8
Перезагрузите программу. Все должно стать на свои места.